O Campeonato Cearense 2013 será disputado em quatro fases. Na primeira, os nove clubes participantes se enfrentam em jogos de ida e volta na fase classificatória. Os seis melhores colocados garantem vaga na segunda fase, sendo que o campeão ganha dois pontos e o vice com um ponto para a etapa seguinte do torneio, que seguirá o mesmo formato e contará com Fortaleza e Ceará (envolvidos na Copa do Nordeste).

Os quatro melhores times classificados na segunda fase se enfrentarão em semifinais com partidas de ida e volta definidas por cruzamento olímpico. Na final, outras duas partidas até se conhecer o campeão.

Em caso igualdade de pontos na fase classificatória, os critérios de desempate são, nesta ordem:

a) Número de vitórias;

b) saldo de gols;

c) número de gols a favor;

d) confronto direto (em caso de empate entre dois clubes),

e) sorteio

As duas equipes que somarem menos pontos na primeira fase da competição serão rebaixadas para a Segunda Divisão em 2014.